Az első koronavírusos esetet Szlovákiában csak 2020. március 6-án erősítették meg. Szlovákia a kezdetektől fogva számos megelőző intézkedést hozott a betegség terjedése ellen.
Pellegrini ezután felszólította a lakosságot, hogy oltassák be magukat az influenza ellen, és ne terjesszenek pánikot. Peter Pellegrini kormánya március 11-i ülésén rendkívüli állapotot hirdetett ki a másodfokú közegészségügyi veszély miatt.
A koronavírus első áldozata egy idősebb nő volt, aki 2020. március 18-án halt meg. A boncolás szerint a halál oka szívroham volt.
Egy másik koronavírusos beteg március 31-én halt meg otthon tüdőgyulladásban, miután hazaengedték a bajnóci kórházból. Mindkét halálesetet hivatalosan április 6-án erősítette meg Marek Krajčí egészségügyi miniszter. A betegség terjedésének több mint 22 ezer áldozata volt Szlovákiában.
