Dušan Čaplovič a pozsonyi Comenius Egyetem bölcsészkarán szerzett diplomát 1969-ben. 2002-ig Nyitrán, a Szlovák Tudományos Akadémia régészeti intézetében dolgozott.
1992 és 2001 között a Szlovák Tudományos Akadémia elnökségének tagja volt. 2002 és 2012 között többször parlamenti képviselővé választották, több tisztséget is betöltött a kormányban.
