A minisztérium állásfoglalása szerint a Transparency szervezet nem dolgozik objektív adatokkal, hanem szubjektív vélemények alapján dolgozta ki értékelését, olyan emberek nézetei alapján, akik kiléte ismeretlen és a vállalkozó szférába tartoznak.
A minisztérium szerint a szervezet manipulál, mert azt állítja, az értékelésben elsősorban a büntető törvénykönyv módosítása és a Speciális Ügyészség megszüntetése mutatkozik meg, de az adatokat abban az időszakban gyűjtötték, amikor ezek a változások még csak rövid ideig vagy egyáltalán nem voltak érvényben.